平野の各地に散在する池沼と、隣接する小川です。
流れはほどんどなく、底は土で、よく水生植物が繁茂します。
このコーナーでは、主にタナゴやモロコの仲間を展示しています。

海と川を上り下りする魚です。サケは産卵のため海から川へ上りますが、ウナギは逆に川から海へ下ります。
スズキは川の汽水域まで上ります。
このコーナーでは、ウナギ、スズキ、小型のカニ類を展示しています。

外国から来た魚たちを外来魚と呼びます。アメリカナマズなどは養殖用として導入され、オオクチバスなどは釣の対象魚として導入されました。
近年では外来生物法という法律ができ、オオクチバスやコクチバス、ブルーギル、アメリカナマズなどは、日本の在来種にとって特に危険度の高い魚にランクされるため、飼育などが禁止されています。